Embora
Saint-Martin não rompa com a visão de uma Natureza globalmente alquimista, onde todos os corpos tendem a despojar-se de suas cascas grosseiras para devolver ao Principio que os anima o brilho intrínseco, ele insiste que a verdadeira Grande Obra reside no reconhecimento do Principio divino, cujo amor oferece aos homens o conhecimento das leis secretas da Natureza apenas para ajudá-los a reconhecer os traços do modelo vivo perdido de vista. Esta prioridade tende a ser esquecida pelos filósofos herméticos que aproveitam a semelhança aparente entre Natureza e Sobrenatureza para autonomizar a sua Arte e remitologizar a Criação, reconhecendo a luz natural como apta a transfigurar as formas visíveis sem que ela mesma seja iluminada e orientada pela luz divina, um debate que remonta aos argumentos de santo
Agostinho sobre o culto das imagens no Esculápio atribuído a Hermes Trismegisto. Ao reconhecer na terra o ponto de reunião de todas as virtudes criadas e o cadinho das almas e dos corpos,
Saint-Martin tende a racionalizar a visão alquímica da Natureza, postulando que as transmutações ocorrem porque os diferentes germes inatos em cada corpo se separam para agir segundo a sua lei sem sair do seu reino, o que torna obscura a compreensão de como uma dinâmica comum de transmutação poderia inflamar a Natureza inteira e elevá-la até Deus, momento em que a ciência se preparava para demonstrar a impossibilidade das transmutações e a teosofia para ocultar a potência transmutante de uma visão conatural às duas luzes em favor de um retorno à teologia.