Os adversários de
Trithemius, Bovillus, Wier e Del Rio, tomaram a Steganographia por um manual de magia demoníaca perigosa e não fizeram nenhuma tentativa de interpretá-la como tratado criptográfico, enquanto o próprio
Trithemius, na prefácio da obra, em cartas e numa Apologia dirigida contra Bovillus, negou enfaticamente que o livro versasse sobre magia demoníaca ou qualquer coisa incompatível com a piedade cristã, sustentando que as invocações eram apenas um disfarce para preservar segredos importantes do vulgo.