A metafísica do Ser formulada por Mollâ Sadrâ é “revolucionária” no sentido de que derruba completamente a metafísica das essências herdada de Fârâbî e Avicena. A ontologia dos peripatéticos considerava que uma essência é imutável, ou seja, que uma essência ou quididade (mâhîyat) é o que é, sem que seu ser implique necessariamente em sua existência; esta última é um atributo que é adicionado à essência: em outras palavras, a existência é um predicado da quididade. Mollâ Sadrâ inverte essa perspectiva. Agora é a quididade que é o predicado da existência, já que é pelo fato de existir que o ser é o que é. Na metafísica das essências, o ser não é a existência, mas a simples cópula do julgamento lógico, daí o divórcio entre o pensamento e o ser. O pensamento, portanto, isola os dois parceiros e, dependendo do fato de decidir a favor da prioridade de um ou de outro, chega à conclusão de que um é a qualificação do outro. Por outro lado, a metafísica de Mollâ Sadrâ, ao rejeitar essa diferenciação entre ser e existir, dificilmente admite que haja um ser que não exista, pois isso seria contraditório com a própria noção de ser. Há uma união sui generis entre quididade e essência. “O ato de existir é a própria quididade existindo, não algo que ela tem ou algo que lhe é acrescentado. Em suma, o conceito de ser é o próprio conceito de sua realização, de essenciação efetiva (tahaqqoq), de atualização determinada, seja em indivíduos concretos (fî’l-a’yân, in singularibus) ou em pensamentos.” Assim é com o Ser, como com a luz que precede e antecipa toda representação possível e que não pode ser definida por nada que seja mais brilhante.
Sohrawardi, por exemplo, também professou uma metafísica de essências, mas sua filosofia “oriental” baseada no Xvarnah postulou a mobilidade do Ser devido à intensificação e degradação da luz ascendente de Oriente em Oriente. Por outro lado, a noção de istihzâr, tornar presente, implicava a ideia de presença em outros níveis do Ser. É por isso que podemos dizer que se trata de uma metafísica da Presença que ainda não ousa afirmar seu nome. Mollâ Sadrâ tinha a convicção íntima de que estava completando o trabalho de Sohrawardî, assim como Sohrawardî tinha o sentimento não menos íntimo de que estava assumindo a filosofia oriental de Avicena. “Mollâ Sadrâ tinha consciência de que estava acrescentando ao edifício o que lhe faltava, e é por isso que a ligação entre Sohrawardî e Mollâ Sadrâ é um grande momento na história filosófica do Irã.
Assim, esse ato de ser pode ser localizado em todos os graus da escala do ser, desde a existência mental (wojûd dhihnî) até as existências sensíveis, imaginativas e inteligíveis. Segue-se que todos os seres participam juntos dessa realidade do ser; eles estão associados a ela por uma participação no conteúdo do próprio conceito (ishtirâk ma’nawî), não por uma mera participação verbal ou homônima (ishtirâk lafzî). Essa comunidade espiritual (ishtirâk ma’nawî) possibilita, assim, englobar a totalidade da existência, inclusive o Primeiro Ser, em uma mesma participação: a unidade do ser (wahdat al-wojûd). O resultado é que, ao contrário da metafísica das essências, uma essência, de acordo com seus modos ou atos de ser, longe de ser fixa e imutável, experimenta até mesmo momentos de intensificação e momentos de enfraquecimento. O universo de Mollâ Sadrâ é um mundo no qual as essências passam por metamorfoses contínuas, de modo que a escala dessas transformações é praticamente ilimitada. O movimento é, portanto, introduzido até mesmo na própria categoria de substância, e isso dá origem a um “movimento intrassubstancial” (harakat jawharîya) em todos os níveis de existência. Mollâ Sadrâ fala de “uma mobilidade, uma inquietação do ser, que se espalha de um extremo a outro da escala dos seres e, portanto, da capacidade de uma essência de passar por um ciclo de metamorfoses, cujos estágios marcam tantos planos do universo”.
Para a metafísica das essências, o status do homem, por exemplo, é constante. Para a metafísica de Mollâ Sadrâ, que é acima de tudo existencial, um ser como o homem compreende uma infinidade de graus, desde “o dos demônios com rosto humano até o sublime estado do Homem Perfeito”. O corpo, portanto, passa por uma infinidade de estados, desde o corpo material e perecível até o corpo arquetípico, e até o corpo divino (jism ilâhî). Consequentemente, a mesma essência pode passar por infinitos graus de intensificação e degradação: as almas podem ser mais ou menos almas, os homens podem ser mais ou menos homens, e a definição clássica do homem como um animal racional não é de modo algum uma ideia fixa, congelada em uma medida válida para todo ser humano, porque o movimento intrassubstancial leva essas essências para cima e para baixo na escada infinita do Ser. É por isso que a metafísica de Sadrâ torna necessária a existência de intermundos, elos intermediários capazes de assegurar o contínuo fluxo ascendente e descendente das metamorfoses. Daí também a existência das Ideias platônicas, ou do mundo do imaginal, que permitem a diferenciação de essências que passam por três modos principais de existência: existência material, existência imaginal, existência inteligível. Daí também a ideia de existência mental (wojûd dhihnî), verdadeira existência no nível do pensamento, já que uma essência, sendo desde o início um ato de existência, existe realmente tanto no nível do pensamento quanto concretamente no nível do sensível. Essa tese reverte qualquer divórcio entre pensamento e ser e exclui qualquer separação que oponha ser e existir.
Todas as essências passam por intensificações e degradações, variações, mutações, metamorfoses (tahawwol), com exceção da “Existência divina primordial, que”, diz Sadrâ, “não tem quididade, porque é o ato de ser em seu estado puro, do qual é inconcebível que possa haver um mais completo, mais intenso ou mais perfeito”. Mollâ Sadrâ rejeita tanto a metafísica peripatética que faz do ser um predicado da essência, quanto a visão de um certo sufismo que tenderia a fazer de “cada quididade individualizada um mero acidente da Existência única”.
No entanto, essa posição de tese (segundo a qual não há essências imutáveis, mas que cada essência é determinada de acordo com o grau de intensidade de seu ato de ser) exige outra: a do movimento transubstancial ou intrasubstancial que introduz a mutação, a variação no próprio núcleo da substância e faz de todo o universo um Retorno ao Ser. Corbin resume o fundamento final da filosofia de Sadra da seguinte forma: “Mollâ Sadra é o filósofo das metamorfoses e transubstanciações. Sua antropologia está em perfeito acordo com a escatologia do xiismo, expressa na expectativa da parusia do décimo segundo Imâm como o advento do Homem Perfeito. Essa antropologia está ligada a uma cosmogonia e psicologia grandiosas: a queda da Alma no abismo dos abismos; sua lenta ascensão de grau em grau até a forma humana, que é seu ponto de emergência no limiar de Malakût…; a extensão da antropologia em uma física e metafísica da ressurreição. O conceito de matéria não será nem o do materialismo nem o do espiritualismo. A matéria passa por um número infinito de estados: há a matéria sutil, espiritual (mâdda rûhânîya) e até mesmo a matéria divina. Nesse ponto, Sadrâ está em profundo acordo com os platônicos de Cambridge, assim como está com F.C. Œtinger (Geistleiblichkeit).”